АГРОПЛЕМТЕХ Войти

Геномная оценка и подбор племенных пар для молочного скота

Племенная ценность вашего стада и подбор быков с объяснением каждой пары

Оценка по продуктивности, родословной и генотипам самого стада. План закрепления, в котором видно, сколько прогресса даёт каждая пара и чего он стоит по инбридингу.

Пара из плана демонстрационного стада

Матка · 1-е место в плане

A0023630

индекс цели

+56 232 ₽

Бык · семя сексированное

E0023912

индекс цели

+8 200 ₽

Инбридинг потомка
4,4 %
Порог пары
6,25 %
Запасных быков
2

Решатель доказал оптимум плана: 1 031 матка закреплена за 31 быком. Дочери лучше маток на +3 866 ₽ по индексу за одно поколение.

7 289
животных оценено одношаговой геномной моделью (ssGBLUP) — с точной достоверностью каждой оценки
1 139
маток — доказанный оптимум подбора быков за 25 секунд, с проверкой летальных рецессивов
1,92 п. п.
ниже инбридинг потомства при той же ценности, чем у подбора «лучших к лучшим» без порога пары

Измерено на демонстрационном стаде платформы

Что считает платформа

Племенная ценность по данным стада

Одношаговая геномная оценка (ssGBLUP) либо BLUP по родословной, многопризнаковая. Достоверность каждой оценки, проверка смещения методом LR, сверка с BLUPF90.

Индекс цели хозяйства

Индексы реестра, ИПЦ-18 по формуле ВНИИплем, своя цель зоотехника по долям признаков — или экономический индекс из цен хозяйства и выживаемости в его стаде.

Рейтинг и каталог быков

Коровы, тёлки и быки по индексу с достоверностью. Быки любых поставщиков — в одной шкале, из них собирается команда для подбора.

Закрепление с объяснением

Доля быка, запас доз, порог инбридинга пары, носительство летальных рецессивов. У каждой пары — прирост и инбридинг потомка, у коровы — запасные быки.

Кривая «прирост ↔ инбридинг»

Сколько ценности стоит каждая сотая доля среднего инбридинга — и пять базовых стратегий подбора рядом, с разложением выигрыша.

Проверка на истории стада

Оценка по данным на дату среза, план на эту дату против фактического подбора, прогноз против первой лактации дочерей, родившихся после, — внутри групп сверстниц.

Геномика стада

Геномный инбридинг по участкам гомозиготности (F_ROH) и по маркерам, носительство по самим мутациям, проверка происхождения по SNP (ICAR), основные предки.

Прогноз и семя

Прогноз генетического прогресса по плану, расход и запас семени, внешние оценки быков (тройки CDCB), приведённые к шкале стада.

Качество данных

Выгрузки Селэкс и генотипы — с проверкой: карантин с причиной по каждой записи, до того как данные повлияют на оценку.

Компромисс между прогрессом и инбридингом — на виду

Кривая строится по животным вашего стада точным методом. Рядом — базовые стратегии подбора, от случайного до ассортативного, чтобы выигрыш было с чем сравнить. Предел инбридинга выбирает хозяйство.

ассортативный подбор случайный подбор средний инбридинг потомков → средняя ценность плана →

Прогресс сохраняется на 88 %, инбридинг потомков удержан на уровне кривой

Схема принципа; на платформе кривая строится по данным стада.

Три шага

  1. Загрузите данные

    Выгрузка из программы учёта, генотипы с чипа, каталог быков. Платформа сверяет колонки, находит дубликаты и разрывы родословной, сомнительное уходит в карантин с причиной.

  2. Оцените стадо

    Оценка идёт в фоне, состояние видно в очереди задач. Результат — племенная ценность и достоверность по каждому животному, рейтинг по цели, тренд по годам рождения.

  3. Постройте план

    Команда быков, порог инбридинга, доля быка — оптимизатор закрепит пары и объяснит каждую. Кривая компромисса подскажет предел инбридинга для стада.

Чем отличаемся от программ подбора поставщиков семени

Как принято

  • Подбор привязан к каталогу одной компании и идёт через её консультанта.
  • Рекомендация выдаётся без объяснения — «чёрный ящик».
  • Опора на национальную оценку другой страны, которой у российского стада нет.
  • Инбридинг — по родословной на несколько поколений.
  • Компромисс между прогрессом и инбридингом скрыт в настройках программы.
  • Что случилось с данными при загрузке — не видно.

АГРОПЛЕМТЕХ

  • Каталог любых поставщиков в одной шкале; зоотехник работает сам.
  • Каждая пара объяснима: прирост ценности, инбридинг потомка, носительство, достоверность каждой оценки.
  • Собственная геномная оценка стада, сверенная с BLUPF90; внешние оценки быков приводятся к ней.
  • Геномное родство, инбридинг по участкам гомозиготности и по маркерам, носительство по самим мутациям, происхождение по ICAR.
  • Компромисс виден на кривой и регулируется хозяйством.
  • Карантин с причинами по каждой записи, журнал действий, роли и права.

Частые вопросы

Нужна ли национальная геномная оценка, чтобы пользоваться платформой?

Нет. Платформа считает собственную оценку по данным стада: продуктивность, родословная и генотипы животных хозяйства. Внешние оценки быков из каталогов поставщиков приводятся к шкале стада и используются рядом.

Какие данные нужны для начала работы?

Выгрузка из программы племенного учёта (например, Селэкс) с животными, родословной и лактациями; при наличии — генотипы животных и каталог быков с запасом доз. Данные проверяются при загрузке, сомнительные записи попадают в карантин с указанием причины.

Чем подбор на платформе отличается от подбора в программе поставщика семени?

Каталог не ограничен одной компанией, зоотехник работает сам, а каждая рекомендованная пара объяснена: прирост ценности, инбридинг потомка, проверка носительства и достоверность оценок обеих сторон. Компромисс между прогрессом и инбридингом показан кривой и регулируется.

Как получить доступ?

Учётные записи и права выдаёт владелец платформы: хозяйство получает своё пространство данных, пользователи — роли (зоотехник, руководитель, лаборатория, просмотр). Вход — по кнопке «Войти»; демонстрационный доступ — по телефону или письмом.

Демонстрационный доступ и подключение хозяйства

Вопросы о платформе — по телефону или письмом.